继2005年重庆市农科院成功建立鲜食玉米渝糯系列的RAPD-PCR特征指纹图谱后，重庆市农科院生物技术研究中心DNA指纹图谱研究又取得了新突破。通过两年来的研究，目前已建立了更加稳定可靠、适用于DNA指纹图谱研究的玉米SSR-PCR分子标记技术体系。利用这一体系，筛选出了10对核心引物和20对次核心引物，建立了重庆市“十五”期间审定、选育的玉米新品种及2005年~2007年部分主推品种共50个材料的SSR指纹图谱及数字指纹。运用SSR-PCR指纹图谱鉴定技术，共完成了12个玉米样品的纯度检验和品种一致性鉴定，分析样品代表种子数量30万千克，及时为企业经营决策提供了科学依据。除玉米外，水稻SSR指纹图谱鉴定技术体系也趋于成熟，筛选出了24对核心引物和24对次核心引物，可用于DNA指纹图谱建立及品种一致性鉴定。

　　DNA指纹图谱是目前最先进的遗传标记系统，它直接反映种子的遗传物质在DNA分子水平上的差异，不受季节和环境的影响，具有高效准确、经济简便的特点。推广应用该项技术可以有效地杜绝假冒伪劣种子进入市场，保护新品种的知识产权，也可为种子开发部门节约种子纯度异地鉴定费用，从而推动种子产业的健康发展。