1.化学药物法防治：培养料用0.1%的敌敌畏熏蒸闷杀，喷药后密闭菇房一天可彻底杀死(此法主要在出菇前使用)。场地用0.3%的敌敌畏+0.1%敌杀死喷熏，料面或菇房用磷化铝熏蒸(10克/立方米)，用薄膜封闭菇房(料面)或关闭门窗。20℃左右时熏48小时，25℃以上时熏24小时，杀虫效果可达95%-100%(注：磷化铝有剧毒，使用时要注意安全)。此法主治菇蛆、菇蝇、菇蚊和螨类等。

　　畦栽料面发生虫害时，可喷洒1%-2%的洗衣粉溶液对菇蝇、老幼螨均有极强的触杀作用。

　　因害虫喜欢在透光阴凉的地方活动，将灭害灵液喷在透光的塑料薄膜上，每天1-2次，连喷3-4天，可杀死飞虫成虫。拌料时加入0.5%食盐、3%石灰、5%-8%草木灰有极强的驱虫和预防作用。

　　2.诱杀防治：在菇房内装上一明亮灯泡，下面放一盆水，然后向水中滴入煤油，对诱杀菇蚊、菌蚊、黑腹果蝇及蝼蛄等成虫效果极好。

　　用糖醋液诱杀，按糖、醋、白酒、敌敌畏、水2∶3∶4∶1∶90的比例配成药液，用纱布或棉球浸药，取出拧干盖于料面上，害虫闻到糖醋味即爬到药布或药棉上而被毒死。

　　将害虫喜欢吃的食物和毒药混拌，如将醋、糖、敌敌畏、炒黄的麸皮按1∶5∶10∶84的比例拌匀，撒干菇床四周及料面让它们吃食。而对菇蝇、菇蚊、线虫等害虫也可以用草木灰+除虫菊(1克/平方米)在料面上均匀撒一层，连撒2-3天，效果很好，既可治虫也可防病。另外，搞好环境卫生，保持清洁，选用抗病、抗杂菌、抗逆性强的优良菌种，采用高温杀菌或高温闷料杀灭，以及人工捕捉和对所用工具进行严格消毒等方法均可收到很好的效果。