对于新生儿医疗费报销问题，目前各地规定不一，属于有争议的问题。大致分以下几种情况：

　　一、如果新生儿的父母(双方或者其中一方，要求双方参合的地区较我)参加了该年度的合作医疗，在该参合年度分娩的新生儿患病治疗费用，可以享受报销待遇。申请报销时可依父母的名义申请，特别注明”“XX之子(女)，一些地区还要求提供新生儿的出生证明。

　　二、新生儿的父母在该年度参合，但新生儿未在该年度参合人员名单中，故新生儿的医疗费用不予报销。

　　合作医疗属于试点阶段，各地对此规定不一，上级部门对此问题多数未明确规定如何处理，能否报销由各地自行决定，建议楼主到你们当地的合作医疗管理部门咨询一下吧，如果当地已有明文规定不能报销，那只能表示遗憾，如果没有明文规定不能报销，也没有明文规定能报销，多做做合作医疗管理部门的工作，必要的时候通过信访途径解决。